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由Michael G. Lemieux

癌症信号通路样本癌症 - 无论职业,种族或性别如何,几乎每个人都熟悉的术语。几乎没有其他疾病接受尽可能多的疾病数十亿美元的资金或者从研究人员中共同关注。然而,科学家们尚未杀死野兽。在全球范围内,每年出现数百万个新的癌症病例以及数百万人死于癌症相关的并发症。尽管这些严峻的统计数据,攻击癌症的新策略在实验室产生了有希望的结果,而且Addgene通过帮助制造来加速这项研究新癌症资源研究社区轻松访问。

什么是癌症,真的?

虽然癌症在分子水平上非常复杂,但在细胞层面存在普遍主题 - 不受控制的细胞增殖。我们已经赞赏这种不受控制的扩散的原因,特别是原癌癌,肿瘤抑制剂及其蛋白质产品。原癌基因组成的一组基因/蛋白质,当表达时,通常促进细胞存活,生长和增殖,而肿瘤抑制剂进行相反的任务,使细胞除去控制。可以分别将原甲酰化和肿瘤抑制器的作用与分别与载体的加速器和制动踏板进行比较。在永久地“开启”的突变的突变的情况下,(现在是癌基因),这类似于车辆的速度堵塞的加速器。类似地,转动肿瘤抑制器“OFF”的突变类似于不起作用的制动踏板。两种情况都产生相同的结果 - 载体的不受控制的运动,或者在癌症的情况下,不受控制的细胞增殖。因此,它对生物体的健康是阶段的健康,即两类基因函数通常是为了维持平衡 - 促进细胞仅在正确的时间和正确的地方划分。

检查和平衡:保护癌细胞

幸运的是,有几种安全机制可以在某些事情开始时保护我们免受流氓细胞。编程细胞死亡或细胞凋亡的过程是一种这样的机制。当细胞或其遗传物质损坏超越修复时,该细胞通常将其致力于凋亡途径并从身体中消除。然而,在癌症的情况下,由于所涉及的特定基因,凋亡途径被规避。肿瘤抑制剂的下调和原癌基因的上调可以直接抑制细胞进行编程细胞死亡的能力,同时刺激生长和分裂。综合效应是未调节的增殖。

另一个安全网是我们自己的免疫系统,它可以识别癌细胞上的抗原并将它们从体内清除。免疫系统虽然有效,但并不总是能消灭每一个癌细胞。即便如此,为了构成最大的威胁,癌细胞仍然需要成功地渗透到循环系统或淋巴系统来扩散或转移。由于循环系统和淋巴系统对许多类型的细胞来说都不是理想的环境,许多癌细胞将会死亡。

从蛋白质到途径 - 作为模型的RAS

当发生突变并且随后发生癌症,传统化学疗法已经利用了癌细胞的普遍分裂行为,攻击分裂所需的细胞机械。这种方法也杀死了脱癌细胞,例如毛囊中的那些,并衬里消化系统,引起不适和疾病。此外,取决于具体类型的癌症,化疗并不总是有效的。这就是为什么癌症研究领域的工作的原因专注于挑选参与不同癌症的复杂的细胞途径,并鉴定所涉及的关键蛋白的作用,目标是能够歧视和有效地消除癌细胞身体。最突出的是ras途径。术语“Ras”共同是指由一系列原癌基因系列编码的3个蛋白质(H-RAS,K-RAS和N-RAS)。Ras蛋白是特殊的,因为已知它们在多达30%的情况下突变全部癌症,特别是胰腺和结肠的癌症。

尽管Ras基因突变在多种癌症中很普遍,但Ras蛋白多年来一直困扰着制药行业。事实证明,由于它们异常“光滑”的形状和缺乏“可用药”的域,它们很难靶向治疗。换句话说,Ras蛋白天然缺乏可接近的、高亲和力结合靶点的潜在治疗药物。尽管如此,这个难以捉摸的目标仍有一线希望。最近计算机建模的改进已经使研究人员开始发现和设计在抑制Ras的能力方面显示出一些希望的分子。田纳西州纳什维尔范德比尔特大学的Stephen Fesik团队已经证明了一些新的小分子可以直接与K-Ras结合,尽管很弱,并抑制其激活。下一步可能是跟踪这些有希望的结果,定制小分子以获得更高的亲和性。加州大学旧金山分校的Kevan Shokat小组正在研究Ras问题,他们利用在人类癌症中最常见的Ras的不同突变版本,并合成化合物专门与它们突变的残基结合。

对于RAS研究人员来说,最令人兴奋和相对较新的资源之一是RAS途径克隆集合2.0。该系列是一组用于使用的向量网关克隆平台(Life Technologies,Carlsbad,CA)代表RAS信号通道的180个基因。它的主要吸引力是,它能够简单地构建载体,以研究任何这些基因的功能通过几种不同的应用,如荧光蛋白融合研究和突变细胞系的产生。此外,对于试剂盒中的每种质粒,在所有TCGA肿瘤样品中最常见的转录物被表示,使得任何此类研究的结果尽可能依赖于临床相关。

连接研究界 - Addgene的癌症收集页面

Ras信号通路截图

科学家正在取得进步。新资源和技术几乎每天都可以使用,但仍然存在障碍。今天研究人员面临的最大挑战之一是参与癌症发展的途径的复杂性。只有数百个基因涉及RAS途径的单独途径和数千个研究人员,我们如何确保研究界可以访问所有最新资源?为了应对这一挑战,Addgene已经启动了一项旨在策划我们对癌症相关质粒的收集的倡议,使得各自与已知的主要途径连接。现在,使用我们的新手癌症研究质粒和资源页面,调查人员可以选择一种途径并识别其实验室感兴趣的途径内的任何基因。单击感兴趣的基因单击单击会将调查人员指向他或她可以用来研究其的所有可用腺体质粒的清单(如下屏幕截图所示)。

Pten质粒表

目前,该页面包括交互式地图拉斯MTOR., 和P53.途径。策划项目继续迅速发展,并且随着研究界的帮助,将很快扩大到包括其他几种重要途径。我们邀请来自研究社区所有成员的反馈和贡献,因为我们继续建立和开发这一新资源!请在下面的意见部分留下您的思想。


Mike Lemieux爆头Michael G. Lemieux是Addgene的一名科学家,对教育和科学写作感兴趣。

参考文献

1. Martz,Colin A.等人。“系统鉴定信号传导途径,赋予抗癌耐药性。”科学信号传导7.357(2014):ra121。PubMed.PMID:25538079。pmed中央PMCID: PMC4353587

2。Stephen,Andrew G.等人。“拖回戒指中的ras。”癌细胞25.3(2014):272-281。PubMed.PMID:24651010

3.Ledford,Heidi。“RAS文艺复兴。”自然520.7547(2015):278-280。PubMed.PMID:25877186

4.之前,伊恩A.,Paul D. Lewis,和Carla Mattos。“癌症中Ras突变的综合调查。”癌症研究72.10(2012):2457-2467。PubMed.PMID: 22589270。pmed中央PMCID: PMC3354961

5。太阳,齐,等。“发现与K-Ras结合并抑制SOS介导的活化的小分子。”《应用化学》124.25(2012):6244-6247。PubMed.PMID:22566140.。pmed中央PMCID:PMC3620661.

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