早期职业研究员工具箱:免费在线分子生物学工具

由贝丝学会主席

Beth Kenkel.

底漆设计。质粒映射。DNA序列分析。我们都拥有我们最喜欢解决这些特定任务的工具,但它们往往会分散互联网。为了帮助您保持虚拟分子生物学工具箱,今天的帖子包括一个地方的免费在线分子生物学工具列表。

质粒映射

这些工具用于查看,编辑或制备质粒图,但也可以分析和注释任何DNA序列。

  • Scangene Viewer.:免费的Snapgene Viewer非常适合查看质粒贴图并查看测序迹线,而付费版本为质粒映射和设计提供了更多工具(图1)。
  • 卧改:虽然您可能会想到卧式作为电子实验室笔记本,但它也有一套分子生物学工具,可以制作质粒图。免费学术用户。
  • 基因组编译器:基于Web或桌面的基于桌面的质粒设计和映射。
  • 连续切割:基于桌面的基于桌面的软件,用于质粒设计和映射。
  • 质粒编辑器:一个免费的、基于捐赠的质粒分析工具,包括编辑、注释、创建地图等。该工具由犹他州大学的M. Wayne Davis维护。

由snopgene产生的PET21a-Bira的质粒图
图1:在蓝色火焰质粒pET21a-bira的Snapgene中产生的质粒图。

DNA /蛋白质数据库搜索和分析工具

Addgene的分析序列工具显示了DNA序列和BLAST,对齐,消化和翻译序列的选项
图2:Addgene的Analyze Sequence工具。

DNA序列操纵工具

有时,DNA序列需要“清理”或以某种方式改变,才能进行分析。这些工具有助于解决这个问题。

  • DNA序列反向补体工具:输入DNA序列,程序将为您提供反向序列,补充序列或反向和补充序列。
  • 筛选DNA工具:从DNA序列的文本中删除非DNA字符,如数字和空格,使其可以复制和粘贴到其他应用程序

底漆设计工具

许多上述质粒映射工具具有内置的底漆设计工具,但这里有一些独立的普通底漆设计网站,以及用于不同克隆应用的底漆设计。

克隆连接反应计算器

这些链接可以帮助您计算不同类型的克隆方法所需的插入和骨干,例如限制酶克隆,Gibson组装或融合克隆。

实验室数学计算器

这些计算器可以帮助您在实验室中执行的常见计算。

如果您正在寻找更多在线Molbio工具,请退房lab。LabWorm让科学家们提交他们最喜欢的在线科学工具,然后投票选出他们最喜欢的工具。这是寻找新工具并分享使用这些工具经验的好方法。

您是否在当今帖子中有没有列出的在线分子生物学工具?在下面的评论中分享它们。

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话题:质粒克隆质粒职业生涯早期研究

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