全球共享用于COVID-19研究的质粒

由詹妮云顶娱乐 韦德国际弗曾

过去几周,我们收到了2600多个新冠肺炎相关质粒请求。这些质粒已经被送往43个国家的研究实验室。

新冠肺炎研究进展迅速,我们很高兴加入这些努力,通过质粒共享等方式帮助科学家。这些包括已经在储存库中存放了多年的质粒,以及科学家们在过去几周内存放的新质粒。我们已经收集了超过500个与COVID-19相关的质粒,通过共享试剂加速研究的任务从来没有像科学家昼夜不停地寻找COVID-19解决方案那样重要。分享科学的速度。

带有蛋白质、包膜和RNA标记的SARS-CoV-2病毒颗粒
图1:SARS-CoV-2蛋白及其他成分。从图片我叫Maya Kostman

我们不仅在这段时间里支持学术科学家,我们还提供了一些给工业科学家质粒而且,这个收藏一直在扩大!在我们的COVID-19质粒和资源页面中,业界可获得的所有COVID-19质粒都有明确标识。此外,为了让您更容易找到用于COVID-19研究的新质粒,该页面每天都会更新。

请访问Addgene的COVID-19质粒和资源页面

下面是一些精选。(我们还分享了大量的质粒来自银杏生物工场,这将在未来的博客文章中重点介绍。)

最近COVID-19研究中沉积的质粒

SARS-CoV-2受体识别

方力的实验室确定了晶体结构病毒刺突蛋白受体结合域与ACE2之间的相互作用。此前,人们发现SARS冠状病毒(导致2003年SARS爆发的病毒)中的刺突蛋白与ACE2结合。该实验室研究了SARS-CoV-2、SARS-CoV和与SARS-CoV-2密切相关的蝙蝠冠状病毒RaTG13的相互作用。它们的沉积包括表达ACE2和来自SARS-CoV和SARS-CoV-2的刺突蛋白的质粒。

在这里找到这些质粒

分子诱饵阻止S蛋白与人类ACE2受体结合

SARS-CoV-2突增蛋白S结合人体细胞上的ACE2受体,进入细胞内部。但如果它不能结合ACE2受体,它就不能进入人类细胞。埃里克·普罗科的实验室着手寻找分子诱饵引诱病毒远离与人类ACE2受体的结合。他们创造了ACE2的变种,并找出了哪些变种比野生型更能结合S蛋白。从成功的单个突变中,他们结合了突变从而产生更好的结合。该实验室还创造了一种ACE2与IgG或IgA类Fc的融合,这可以在招募免疫效应功能和增加血清稳定性的同时,提供一种增强欲望的方法。

寻找ACE2和ACE2变异质粒

sars - cov -2-人蛋白-蛋白相互作用图谱

克罗根实验室生成了表达SARS-CoV-2开放阅读框架的慢病伟德BV下载毒载体并进行了鉴定这些蛋白质与人类蛋白质的相互作用。29种SARS-CoV-2蛋白中,有26种表达,除1种外,其余均克隆到pLVX载体(用于慢病毒包装)中,并含有IRES-Puro标记,用于稳定的细胞克隆选择。想了解更多关于这些质粒的信息以及他们工作的幕后情况,去看他们的博客吧

在这里找到Krogan实验室SARS-CoV-2表达质粒

密码子优化的SARS-CoV-2开放阅读框架

Fritz Roth的实验室创造了含有SARS-CoV-2开放阅读框密码子优化编码序列的质粒Gateway-compatible输入向量。这使得转移到各种表达和标记载体。

浏览含有SARS-CoV-2 orf的质粒

建立一种检测SARS-CoV-2的单酶RT-qPCR方法

四年前,安德鲁·艾灵顿的实验室进化出了逆转录异种聚合酶可以用于单酶逆转录-聚合酶链反应,而不需要分离互补DNA。这一进展使他们能够快速将该酶用于单酶RT-qPCR检测SARS-CoV-2。他们详细的bioRxiv议定书并存放质粒用于iptg诱导RTX表达。

把RTX质粒拿过来

以前沉积的质粒加快了COVID-19的研究

在COVID-19大流行的许多年前,科学家们从其他研究项目中积累了质粒。这些沉积物帮助研究人员迅速开始了对SARS-CoV-2的研究。

来自斑马鱼研究的质粒将有助于COVID-19研究

在一项与冠状病毒甚至传染病无关的研究中,罗杰·里夫斯的实验室创建了一个包含164个保守蛋白质编码基因的cdna库,用于研究斑马鱼胚胎。其中一种质粒目前正在COVID-19研究中使用,已请求使用50多次。

当时,里夫斯的实验室正在研究人类21号染色体基因的过表达有助于早期胚胎发生。其中一个编码序列是丝氨酸蛋白酶TMPRSS2。在SARS-CoV-2和SARS-CoV感染期间,TMPRSS2切割S蛋白这是病毒和细胞膜融合所必需的。当TMPRSS2被抑制时,病毒无法进入。这个质粒是两个看似不同的领域如何共享试剂的一个很好的例子。

在这里找到TMPRSS2质粒

sars冠状病毒刺突蛋白结合ACE2

在2003年非典爆发期间,Hyeryun Choe的实验室证实了这一点ACE2是sars冠状病毒的功能受体。这为SARS-CoV-2研究人员研究病毒如何与受体相互作用提供了一个很好的起点。他们还发现,当293T细胞表达ACE2时,SARS-CoV可以复制,但病毒不能在模拟转染的细胞中复制。

获得hACE2受体质粒

组织蛋白酶L的蛋白酶活性是感染表达ACE-2的细胞所必需的

在SARS爆发后不久,Hyeryun Choe的实验室发现组织蛋白酶在SARS冠状病毒感染中发挥了作用。2008年,另一组研究人员后来发现组织蛋白酶L触发sars冠状病毒刺突蛋白的蛋白水解,激活其膜融合功能。现在,崔实验室也发现了SARS-CoV-2感染需要组织蛋白酶L的半胱氨酸蛋白酶活性感染表达ace2的细胞。实验室储存了含有人组织蛋白酶S、L和B的质粒。

在Addgene找到组织蛋白酶质粒

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