科学手稿写作:文献检索、阅读和组织

客人的博客

这篇文章由约翰娜·卢斯贡献。这篇文章最初发表在Johnna的阳光下的新博客是她更大的教程系列的一部分,科学手稿写作初学者指南

一堆科学论文任何科学手稿都需要大量的其他科学文献来证实它所建立的事实。这意味着你必须熟悉与该主题相关的大量文献。找到可靠的参考资料并理清它们的含义并非易事。作为一名科学家,将文献检索和阅读作为日常工作的一部分是很有用的。设定一个目标,每周阅读一定数量的论文,以跟上你所在领域的研究。当你在“写作模式”中申请拨款或科学手稿时,阅读可能会更加激烈,但每次跟上科学文献的一点是一个普遍的好习惯。

寻找文学

我查找科学文献的常用搜索引擎是谷歌学者PubMed。您可以搜索关键词,标题,作者,年,窄的文章类型(审查,专利,临床研究,研究文章等)。还有许多选项可以缩小你的搜索范围,并对结果进行排序(相关性,日期等)。标题的链接通常可以把你带到文章的全文- - - - - -通过期刊(尽管你可能需要在一个机构订阅的网络上),存档公共医学中心,或在预印上BioRXIV

你可能会遇到的最大问题之一就是在冗长的游戏列表中筛选对你真正有用的内容。当开始一个新的文献搜索时,试着找到一篇最近的综述文章,给你一个主题的概述,并指向你的相关的主要研究文章。然后开始阅读并跟踪文献中的引用,直到你拥有所有你需要的信息。

阅读主要研究文献

理解科学论文的最好方法就是练习阅读。你所在领域的专业术语和背景有一个学习曲线,但有时论文也只是写得很糟糕。从本质上说,科学文献是信息密集的,因为它不断地建立在以前的研究之上,读者总是进入行动的中间。

如果论文写得很好,摘要应该能让你了解工作的重要性,所做的研究以及它的意义。引言应该给你足够的信息,让你理解将要解决的研究问题。在主要的研究论文中,介绍应该是相当集中的。请查阅一篇综述文章,了解任何特定研究领域中正在发生的更广泛的情况。除非您正在寻找一个特定的协议或试图复制一个实验,否则第一次阅读一篇文章时,方法部分可能不会引起太多注意。

第一次浏览时,只是对研究中使用的技术有个大致的了解,但要等到看到结果部分的数据后再整理出更详细的细节。在您对结果部分进行排序时,这是作者向您展示数据的地方。他们应该解释实验背后的一些基本原理,他们收集了什么数据,它意味着什么。这些数字和结果之间应该有一些联系或流动,最终形成一个整体的结论。

在一些文章中,数据是用来为某个模型或总体结论建立一个案例的。在另一些实验中,实验旨在消除可能性,直到结果集中在一个特定的结论上。许多论文并不总是这样写的,这给读者带来了更大的负担来解释结果,看看它是否会让你得出相同的结论。就我个人而言,我喜欢以某种模型结尾的论文(喜欢漫画)来直观地总结所有的结论。

在任何情况下,读者都应该用批判的眼光看待所有与支持结论相关的结果。看看这些数字,写下你自己的结果;它们和作者给出的描述一样吗?问问你自己,这些结果是否如作者所说的那样。对这些结果还有其他可能的解释吗?然后深入思考他们展示的数据。这些实验是弄清楚到底发生了什么最好的方法吗?数据质量是否足够(错误条,统计数据,图像清晰度等)?他们是否进行了所有适当的控制?关于协议的细节,请参考方法部分。 Are there any red flags about how the work was performed that could influence the results?

同行评议过程并不完美,所以即使它是科学在发表之前验证工作的方式,它并不意味着没有错误或误解。毕竟,科学是由人类完成、编写和评估的。

跟上文学的步伐

有几个方法可以确保你跟上你感兴趣领域的文献。每天或每周留出一些时间,至少浏览一下你研究领域的进展。为阅读论文设定一个目标,即使从每周读一篇论文开始也会很有用。看看这个标签# 365篇论文在推特上寻找灵感和问责。

也有几种不同的方法可以自动化这个过程。从你经常阅读的期刊上注册eTOC(电子目录)提醒。每一期的内容一旦可用,就会立即发送到您的收件箱。让他们快速浏览有趣的关键词,然后下载有趣或相关的内容。

利用谷歌搜索引擎的力量,注册谷歌学术提醒。根据您提供的关键词,谷歌Scholar会每天向您发送相关文献的更新。

组织的文献

作为一名科学家,你将开始收集大量下载的研究文章的PDF文件。它是你自己的数字图书馆,提供有用论文的全文版本。对很多人来说,这个收藏是纯电子的。档案柜里满是重印的文件和页边空白处草草标注的文件的日子已经一去不复返了。如果你喜欢,打印和手写笔记仍然是可能的,但不是对你读过的每一篇论文都可行。所以,你需要想出一个适合你的组织体系。我有一个文件夹,里面存放我所有的论文,它们都有文件名(第一年的作者名)。虽然很简陋,但对我很管用。我经常能记得我需要打开哪张纸,但当我不能打开时,就很容易找到了。编写本教程表明,就我的组织策略而言,我仍然处于黑暗时代。 There are a number of software options for helping you manage your own digital library. Check out论文,Mendeley,CiteULike- - - - - -这些程序提供了更多的选择来搜索和分类你自己的数字图书馆,以及一些与互联网范围内的文献搜索的集成。2015年5月6日更新:这是另一个选择,可能有助于解决你的文献组织问题F1000刚刚宣布推出他们的F1000Workspace

在下面的评论中给出你最喜欢的搜索、阅读和组织技巧。此外,阅读更多科学手稿写作初学者指南约翰娜的博客系列。


感谢我们的嘉宾博主!

赞美约翰娜·卢斯(Johnna Roose)是路易斯安那州立大学生物科学系的生物化学讲师。她是光合作用的爱好者,在她的博客上写自养生物和生物化学。在Twitter上关注她@JLRoose

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